Sans tenir compte de vos précisions (un cata, deux coques, deux alternateurs, etc.), oui :

• le démarreur doit être raccordé directementet uniquement à sa batterie moteur
• l’alternateur doit être raccordé à l’argofet (input)
• une sortie de l’argofet alimente la batterie moteur
• l’autre sortie alimente le parc de servitude
• il faut donc supprimer la liaison directe entre l’alternateur et le démarreur
• 
  Dans ce schéma toute la régulation sera faite par le régulateur de l’alternateur, généralement sommaire et pas très bien adapté à l’utilisation sur un bateau (ils sont prévu pour des automobiles, marché bien plus vaste). C’est là que le bât blesse un peu.

Remarque  : sur PTP on a pas pris le virage répartiteur mosfet et on uitilise le plus souvent un cyrix (ou équivalent) entre la batterie moteur (généralement reliée directement à l’alternateur) et la batterie servitude. Cette dernière n’est alimentée par l’alternateur que lorsque la batterie moteur devient bien chargée (c’est très rapide, on la décharge tellement peu à chaque coup de démarreur) c.a.d dès que sa tension dépasse en gros 13,3V. Le moteur de recherche (en haut à gauche) renseignée avec le mot cyrix vous ramènera du gros, en abondance.

Vous trouverez aussi pas mal de fils concernant les difficultés de régulation en présence de multiple source, ainsi que des fils à propos des catamarans, nombreux retours de vécus.

Je fais personnellement un peu exception, ayant supprimé mon cyrix et installé un A2B (booster d’alternateur, et régulateur plus moderne) entre d’une part le B+ de l’alternateur et d’autre part la batterie moteur (par une sortie pas bosstée, à faible courant) et la batterie servitude (par la sortie amplifiée et modernement régulée). Ce montage compense la sommairitude du régulateur de l’alternateur et me permet dans la vraie vie de recharger les batteries de servitude de 330 Ah avec un courant de 60A

Bon courage.