Difficile de jouer à la voyante.
Ce qui paraît évident est que votre cablage semble étrange : la logique voudrait que pour chaque paire les sections des fils rouge et noir soient identiques, or vous indiquez des trio 1N + 2R...Par ailleurs, si j’ai bien compris une des sorties alimenterait les deux parcs batterie, ce qui parait anormal car les deux parcs seraient en parallèle en permanence.
Je crois que la seule solution est de suivre les fils et de voir où ils sont connectés... La meilleure solution est de tout débrancher et de rechercher les continuités avec un multimètre.
N’y aurait-il pas eu une troisième batterie (propuseur d’étrave/guindeau par exemple) ?
Une autre solution serait que, au cours du temps, le fil rouge de chaque paire partant du coupe-circuit ait été dédoublé quelque part en deux fils rouges arrivant au chargeur (raison du genre : pas de fil assez gros pour rallonger) et qu’en fait chaque sortie alimente bien un des parcs. C’est facile à vérifier...